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首頁 > 商務(wù)會議 > 生物/醫(yī)學(xué)會議 > 多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會11月線上 更新時間:2020-10-14T16:58:37

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多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會11月線上
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多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會11月線上 已過期

會議時間:2020-11-20 08:00至 2020-11-22 18:00結(jié)束

會議地點: 線上活動  詳細地址會前通知  

會議規(guī)模:暫無

主辦單位: 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐永醫(yī)藥科技 上海遐錦生物科技有限公司

發(fā)票類型:增值稅普通發(fā)票 增值稅專用發(fā)票

行業(yè)熱銷熱門關(guān)注看了又看 換一換

        會議介紹

        會議內(nèi)容 主辦方介紹


        多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會11月線上

        多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會11月線上宣傳圖

        ?組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會

        醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室?? 20201120-22日(兩天兩晚)

        【背景介紹】

        2019年度國家自然基金醫(yī)學(xué)科學(xué)部共批資助10138項目,批助金額總計441310萬元。這些項目中大部分都與編碼基因有直接或間接的關(guān)聯(lián)。其中,與通路(pathway)關(guān)聯(lián)的有1349項,金額4.89億;與miRNA相關(guān)的有630項,金額2.3億;與lncRNA相關(guān)的有395項,金額1.45億,與甲基化相關(guān)的有213項,金額8748萬,與突變相關(guān)的有190項,金額7410萬;?

        如何獲得有創(chuàng)新意義的疾病靶標(biāo)基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是項目申請及文章寫作時最常見的問題。

        目前,多組學(xué)整合分析是一個非常熱門且創(chuàng)新的方向。通過多組學(xué)整合分析我們可以更加快速、準(zhǔn)確的找到與研究方向關(guān)聯(lián)的biomarks。它的核心原理是期望通過高通量數(shù)據(jù),找到所有基因在不同組學(xué)水平中的變化并進行分析,獲得關(guān)鍵基因在各個組學(xué)都有顯著作用。

        多組學(xué)整合分析的原始數(shù)據(jù)來源有兩種:(1)自己采集樣本做高通量測序/芯片/質(zhì)譜等;(2)使用公共數(shù)據(jù)庫中的組學(xué)數(shù)據(jù)(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。

        主要內(nèi)容詳細內(nèi)容見下文日程表

        1.多組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫;

        2.多組學(xué)分析常用軟件和工具;

        3.教授對應(yīng)的圖片制作方法(包含但不限于聚類熱圖、火山圖、富集分析圖、Venn圖、pathwaymap)

        【會議預(yù)期】

        通過三天的學(xué)習(xí),了解多組學(xué)整合分析思路對項目及文章的幫助,以及實操常見的數(shù)據(jù)庫、在線工具和本地軟件。使得學(xué)員可以自己完成一個完整的分析報告并獲得疾病相關(guān)的靶標(biāo)基因。

        講師簡介

        宋偉博士

        成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

        研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

        培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓(xùn)班。



        主辦方:上海循掘生物科技中心

        會議時間?

        2020年11月20-22日(兩天兩晚)

        20日 19:00-20:00

        21日 8:30-18:00 及19:00-20:00

        22日 8:30-17:30

        會議地點醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室

        說明研討會使用專業(yè)會議軟件ZOOM,需提前安裝好

        查看更多

        醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

        舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標(biāo)書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

        上海遐永醫(yī)藥科技

        南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

        上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

        上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。

        會議日程

        (最終日程以會議現(xiàn)場為準(zhǔn))


        ?【會議日程】

        日期

        時間

        大綱

        詳細內(nèi)容

        第一天晚上

        19:00-21:00

        第1節(jié):組學(xué)簡介及生信概述

        2019年國自然中組學(xué)相關(guān)項目解讀

        組學(xué)原始數(shù)據(jù)的來源及質(zhì)量判斷

        高通量:測序及芯片介紹——不同組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀組學(xué)、順反組學(xué)、宏基因組學(xué)等。

        文獻案例解讀

        21:00-22:00

        第2節(jié):軟件安裝

        R包安裝

        R簡介及R包安裝

        R基礎(chǔ)講解

        R函數(shù)

        R包


        第二天及晚上

        8:30- 10:30

        第3節(jié):組學(xué)公共數(shù)據(jù)庫

        TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介)及數(shù)據(jù)下載

        GEO數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

        EBI數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

        GEO2R工具使用

        10:30-10:45

        休息

        10:45-12:00


        第4節(jié):轉(zhuǎn)錄組差異基因篩選及功能富集分析

        計算差異基因 -R limma包 或Excel公式

        主成分分析(PCA)圖制作

        聚類熱圖(heatmap)的制作——R pheatmap包

        火山圖(volcanoPlot)——R ggplot2包 或 Excel制作

        箱式圖(代碼 或無代碼制作)

        R clusterProfiler包富集分析

        基因/蛋白功能富集分析——DAVID工具

        功能富集分析 柱狀圖、條形圖、氣泡圖、餅狀圖的R代碼及Excel制作

        12:00-13:30

        午餐及午休

        13:30-17:30

        第5節(jié):多組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床預(yù)后分析

        基因突變分析工具——cbioportal

        在線預(yù)后分析工具——Ualcan

        本地生成KM曲線圖——R survival包

        相關(guān)性分析及散點圖制作

        17:30-19:00

        晚餐

        19:00-22:00

        第6節(jié):轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合分析

        Venn 圖制作

        蛋白與蛋白互作關(guān)系預(yù)測——STRING工具

        網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建與美化——cytoscape軟件

        轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合關(guān)聯(lián)分析思路文章實現(xiàn)


        第三天

        8:30-10:00

        第7節(jié):蛋白組與代謝組整合分析

        代謝物功能富集分析——metaboanalyst工具

        KEGG 數(shù)據(jù)庫介紹及使用

        pathway map制作

        蛋白組與代謝組整合分析思路文章實現(xiàn)

        10:00-10:15

        休息

        10:15-12:00

        第8節(jié):全轉(zhuǎn)錄組整合分析

        各類RNA簡介及ceRNA介紹

        miRNA測序報告解讀

        circRNA測序報告解讀

        miRNA分析工具

        lncRNA分析工具

        12:00-13:30

        午餐及午休

        13:30-15:30

        第9節(jié):其他組學(xué)整合思路

        腸道菌群宏基因組與代謝組

        表觀組與轉(zhuǎn)錄組整合

        15:30-15:45

        休息

        15:45-16:00

        總結(jié)

        總結(jié)及答疑

        ?

        通過本次研討會,您將學(xué)會以下作圖:

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        會議嘉賓


        即將更新,敬請期待

        參會指南

        會議門票


        收費標(biāo)準(zhǔn):會務(wù)費:3200元/人

        優(yōu)惠政策:

        1.提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料

        2.三人組團報名,每人優(yōu)惠100元

        3.四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,

        4.六人組團報名繳費,可免1人會務(wù)費!?

        可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?

        注意事項:必須攜帶win10以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場不得錄音錄像。上課軟件為Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

        ???????

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        溫馨提示
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        主辦方?jīng)]有公開參會單位

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