單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析與研究思路研討會
時間:2020-07-04 08:00 至 2020-07-05 18:00
地點:線上活動
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首頁 > 商務(wù)會議 > 生物/醫(yī)學(xué)會議 > 單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析與研究思路研討會 更新時間:2020-06-22T12:44:19
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析與研究思路研討會 已過期會議時間:2020-07-04 08:00至 2020-07-05 18:00結(jié)束 會議地點: 線上活動 詳細(xì)地址會前通知 會議規(guī)模:暫無 主辦單位: 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐永醫(yī)藥科技 上海遐錦生物科技有限公司
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析與研究思路研討會宣傳圖
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析與研究思路研討會
醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室??7月4-5日
【會議背景】單細(xì)胞測序是從單個細(xì)胞水平對基因組和轉(zhuǎn)錄組進行研究。2015年以來,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術(shù)的出現(xiàn),徹底降低了單細(xì)胞測序的成本門檻。自此,單細(xì)胞測序技術(shù)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研和臨床研究。通過單細(xì)胞測序可以最大程度的反映細(xì)胞的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞群和細(xì)胞亞群,并為闡明細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)換的調(diào)控機理提供了技術(shù)保障。單細(xì)胞技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析方法在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、免疫學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域有重要應(yīng)用,是現(xiàn)今生命科學(xué)研究的焦點。
【會議特色】
本次課程以近期CNS文章為案例主線,逐一詳細(xì)剖析,全程電腦實戰(zhàn)教學(xué)。理論與實踐相結(jié)合,老師將以最簡單易懂的方式,既介紹單細(xì)胞測序的研究方法、分析內(nèi)容和最新前沿進展,又介紹具體的數(shù)據(jù)庫、工具和軟件的使用,并在課堂上進行上機指導(dǎo)。講師經(jīng)驗豐富,教學(xué)深入淺出,能讓大家獲得從單細(xì)胞組學(xué)原始數(shù)據(jù)實現(xiàn)CNS圖形繪制的實戰(zhàn)能力。
【講師背景】
來自中科院,長期從事單細(xì)胞多組學(xué)方面的項目研究,目前已在Nature等雜志發(fā)表文章四十多篇,承擔(dān)國家科技部、國家自然基金委和重點研發(fā)計劃等多項課題。
【主要內(nèi)容】詳細(xì)內(nèi)容見課表
1.熟悉單細(xì)胞組學(xué)圖表解讀和研究思路。
2.掌握單細(xì)胞組學(xué)分析標(biāo)準(zhǔn)流程和常用軟件。
3.熟悉單細(xì)胞數(shù)據(jù)的分型和marker基因鑒定。
4.掌握單細(xì)胞數(shù)據(jù)的軌跡分析及功能富集分析。
5.了解單細(xì)胞課題設(shè)計方法及研究思路。
【預(yù)期目標(biāo)】
本學(xué)習(xí)班由多年從事單細(xì)胞組學(xué)研究的科研人員授課,通過深入淺出的理論講解和實例案例,幫助學(xué)員拓展研究思路,提升科研水平,增加職業(yè)競爭力。通過本次課程培訓(xùn)將使學(xué)員系統(tǒng)掌握當(dāng)前主流的單細(xì)胞組學(xué)分析流程、方法和軟件,從零基礎(chǔ)實現(xiàn)到CNS圖表的繪制,同時提升研究深度和廣度,拓寬研究思路。
【使用軟件】
主要使用R和Rstudio,部分涉及Lniux
另外需安裝ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議軟件,建議電腦安裝
會議時間:2020年7月4-5日
會議地點:醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室
報到地點:提前報名,并安裝好ZOOM軟件。課程開始時進入會議室。?
主辦方:上海遐錦生物科技有限公司
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舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標(biāo)書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......
上海遐永醫(yī)藥科技南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。
上海遐錦生物科技有限公司上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。
會議日程 (最終日程以會議現(xiàn)場為準(zhǔn))
以下為課程詳細(xì)課表
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析及研究思路研討會議程 | |||
第一天上午(理論) | 9:00-10:30 | 單細(xì)胞測序技術(shù)與應(yīng)用 | 1. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)發(fā)展歷程和原理介紹。 |
2. 單細(xì)胞測序技術(shù)在科研領(lǐng)域的應(yīng)用。 | |||
3. 近年單細(xì)胞技術(shù)CNS文章思路解析。 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 單細(xì)胞測序圖標(biāo)解讀及思路 | 4. 單細(xì)胞文章常見圖表解讀。 | |
5. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)在癌癥、發(fā)育、免疫及在植物等領(lǐng)域的研究內(nèi)容及思路。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第一天下午(實操) | 13:30-15:30 | Linux及R語言入門、軟件安裝 | 1. 常規(guī)基礎(chǔ)Linux命令入門講解及實操訓(xùn)練。 |
2. R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。 | |||
3. R語言語法介紹及常用命令。 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-17:00 | R語言數(shù)據(jù)處理實操 | 4. 數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計應(yīng)用。 | |
5. R語言畫圖實操:tSNE,小提琴圖,熱圖,網(wǎng)絡(luò)圖,GO、KEGG富集圖,GSEA等圖形繪制。 | |||
17:00-18:00 | 晚餐及休息 | ||
第一天晚上(理論) | 18:00-21:00 | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程 | 1. 單細(xì)胞高分文章分析思路解析(細(xì)胞類群確定、擬時間分析、差異表達、通路富集、轉(zhuǎn)錄因子、配體受體互作等)。 |
2. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組比對、定量、分群及擬時間分析等軟件及參數(shù)。 | |||
3. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子、功能通路及配體受體互作思路解析。 | |||
4. 單細(xì)胞組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫介紹及使用。 | |||
5. 基因富集分析和可視化。 | |||
第二天上午(實操) | 8:45-10:30 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)可視化、細(xì)胞分型 | 1. 10X官方單細(xì)胞軟件Cellranger講解及實操。 |
2. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 | |||
3. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)marker鑒定及差異分析 | 4. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞鑒定及聚類分析。 | |
5. 通過Seurat及GSVA等進行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組差異分析。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第二天下午(理論+實操) | 13:30-15:00 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)軌跡分析,功能富集 | 1. 通過Monocle軟件進行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組擬時間分析。 |
2. 通過DAVID及metascape網(wǎng)站進行通路富集分析。 | |||
3. 單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析總結(jié)。 | |||
15:00-15:15 | 茶歇 | ||
15:15-17:00 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘思路及標(biāo)書構(gòu)思、準(zhǔn)備 | 1. 歸納總結(jié)零成本單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘思路。 | |
2. 單細(xì)胞測序基金申請思路、準(zhǔn)備內(nèi)容及注意事項等。 | |||
備注:必須攜帶電腦,上課主要軟件為R和Rstudio,涉及部分Linux系統(tǒng),講師會詳細(xì)帶著操作 |
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會議嘉賓
參會指南
會議門票
收費標(biāo)準(zhǔn):會務(wù)費:2800元/人
優(yōu)惠政策:
1. 提前確認(rèn)報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料
2. 三人組團報名,每人優(yōu)惠100元
3. 四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,
4. 五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!?
可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?
注意事項:攜帶windows系統(tǒng)的電腦,安裝最新版本R和Rstudio
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認(rèn)參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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會員折扣
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