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首頁 > 商務(wù)會議 > 學術(shù)/科研會議 > R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班 更新時間:2022-11-23T15:42:05

R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班
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R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班 已過期

會議時間:2023-01-07 09:00至 2023-01-08 18:00結(jié)束

會議地點: 線上活動  詳細地址會前通知  

會議規(guī)模:暫無

主辦單位: 上海循掘生物科技中心

發(fā)票類型:增值稅普通發(fā)票 增值稅專用發(fā)票

行業(yè)熱銷熱門關(guān)注看了又看 換一換

        會議介紹

        會議內(nèi)容 主辦方介紹


        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班

        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班宣傳圖

        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖網(wǎng)絡(luò)研討會

        騰訊會議網(wǎng)絡(luò)會議室 202317-8

        會議簡介:

        眾所周知,R軟件是用來做數(shù)據(jù)分析和作圖的軟件。一篇高質(zhì)量的文章,需要好的原始數(shù)據(jù)、邏輯的分析思路、漂亮的結(jié)果、創(chuàng)新的結(jié)論。其中,批量的分析操作會提高效率,美觀的圖片會讓人眼前一亮,刮目相看的。相同的數(shù)據(jù),做出來的圖片可能大相徑庭。

        下圖就是由同一套數(shù)據(jù)所做的差異基因的表達聚類熱圖,孰優(yōu)孰劣一目了然。

        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班

        R語言特點及優(yōu)勢

        可以用來做生信分析及作圖的數(shù)據(jù)庫database、在線工具web-service、軟件software有很多,其中R軟件是一種適應性最廣、上手最快的工具??赡苡械娜藭幸蓡?,R語言是一種編程語言,我沒有任何計算機的基礎(chǔ)也適合使用R嗎?

        答案是可以的。原因是R軟件做分析及作圖,都有比較現(xiàn)成的R包及代碼。比如轉(zhuǎn)錄組分析相關(guān)的R包及代碼,可以用來做差異分析、火山圖、熱圖、PCA圖、WGCNA等。比如單細胞測序數(shù)據(jù)分析相關(guān)的R包及代碼,可以用來做細胞分型及聚類。還有RNA甲基化分析相關(guān)的、蛋白組代謝組相關(guān)的、臨床統(tǒng)計分析相關(guān)的R包及代碼。

        零基礎(chǔ)的是怎么快速掌握呢?以一個做熱圖的代碼為例子,雖然每個人的數(shù)據(jù)是不同的,但是只要拿到了做熱圖的代碼,我們就可以只是簡單的修改其中幾個參數(shù),就可以輕松作出熱圖!我們只需要記住那幾個關(guān)鍵參數(shù)的含義及修改即可,而且,代碼中還有詳細的中文注釋!

        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班

        當然,如果是我們自學就要花費更多的時間了。所以,我們開設(shè)了這次R語言實操班??梢酝ㄟ^老師系統(tǒng)的整理各個方向的生信代碼及實操,在短短的兩天一晚時間系統(tǒng)的掌握R分析的各種實操

        有很多學員也參加過醫(yī)藥加的其他培訓班,比如單細胞、比如RNA甲基化、TCGA、多組學、非編碼RNA等,它們也有一些R的操作及代碼。我們這次也會系統(tǒng)性的對這些班中的R代碼進行教學演練,希望大家?guī)е鴨栴}解決問題。

        專家簡介:宋博士

        成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

        研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。


        會議預期:通過2天1晚的學習手把手教學讓學員掌握R軟件下載安裝、Rstudio用法、R語言常用作圖、R語言數(shù)據(jù)處理方法與編程技術(shù)、掌握R語言自主學習實踐的方法與技巧,現(xiàn)場解答學員在實際工作中遇到的有關(guān)技術(shù)問題,讓學員更好地掌握相關(guān)技術(shù)的應用。另外,課后學員有感興趣的圖片,老師也可以提供相應的R代碼。

        總體思路是根據(jù)生信相關(guān)的SCI熱點文章為主題,完成里面相關(guān)的分析及作圖。該培訓適用于對生信分析或者醫(yī)學統(tǒng)計學分析感興趣,編程零基礎(chǔ)及以上的學員參加。


        會議詳細日程


        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖日程

        課程

        內(nèi)容

        第一天

        上午

        R語言——編程環(huán)境、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、語法和練習

        R軟件的歷史、簡介、優(yōu)缺點

        R編程形式與資源

        R軟件的安裝

        Rstudio使用技巧及安裝

        R語言的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(元素、向量、矩陣)

        R語言的編程方法

        一起練——R語言的編程練習

        第一天

        下午

        生信參考文獻解讀

        生信文獻的流程解讀

        常用的生信分析流程

        流程模塊使用的R包及函數(shù)簡介

        案例展示

        常用R函數(shù)

        統(tǒng)計編程思想與流程

        數(shù)據(jù)描述性分析R實現(xiàn)

        統(tǒng)計分析R實現(xiàn)

        實戰(zhàn)操作演練——卡方檢驗、回歸分析、方差分析、Fisher精確檢驗、相關(guān)性分析等

        第一天

        晚上

        常用R包(1

        轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀組、代謝組等不同組學數(shù)據(jù)差異基因篩選及可視化

        R包的介紹——r-project 來源及 Bioconductor 來源

        R包的安裝——在線安裝及本地安裝方法

        芯片數(shù)據(jù)預處理——標準化,歸一化

        差異分析——差異基因篩選,火山圖

        無監(jiān)督聚類分析——PCA分析,聚類熱圖分析

        第二天上午

        常用R 包(2

        基因、蛋白相關(guān)分析

        R語言功能富集分析,包括KEGG pathway,以及GO BP, CC, MF分析,功能條形圖,功能氣泡圖可視化

        共表達分析——pearson法,相關(guān)性散點圖

        生存預后分析——KM曲線圖,添加p值,HR

        樣本相關(guān)性及相關(guān)性熱圖分析

        實操

        第二天下午

        常用R包(3

        常見思路

        單細胞測序相關(guān)分析

        RNA甲基化相關(guān)分析

        時間序列分析——多組連續(xù)樣本的基因表達聚類

        實操

        R語言學習的方法與技巧

        算法思想、R包及函數(shù)用法、參數(shù)說明、范例程序

        如何找到有用的R資源

        R語言學習小竅門

        互動環(huán)節(jié)與答疑





        PS:必須攜帶電腦,最好是win10系統(tǒng),蘋果系統(tǒng)需自己安裝好R和Rtudio軟件。會后主辦方會統(tǒng)一提供全程錄像作為復習資料。


        會務(wù)費用3000元

        優(yōu)惠政策

        1. 提前報名并付款的,可以預先拿到學習資料

        2. 三人組團報名,每人優(yōu)惠100

        開具正規(guī)會務(wù)費發(fā)票,提供紙質(zhì)蓋章邀請函

        時間2023年1月7-8日(2天一夜

        第一天 白天 9:00-17:30,晚上 19:00-22:00

        第二天 白天 9:00-17:30

        地點:騰訊會議網(wǎng)絡(luò)會議室


        辦方:上海循掘生物科技中心

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        通過該培訓,可以學會R語言基礎(chǔ)(輸入文件格式、輸出文件格式、操作代碼的參數(shù)調(diào)整)、統(tǒng)計學上各種算法的實現(xiàn)、SCI常用圖片生成等,例如:

        R語言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖(網(wǎng)絡(luò))研討會2023年1月培訓班

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        上海循掘生物科技中心

        上海循掘生物科技中心于2020年2月21日舉辦TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2020(2月深圳班)會議。

        會議日程


        即將更新,敬請期待

        會議嘉賓


        即將更新,敬請期待

        參會指南

        會議門票


        票種名稱 價格 原價 票價說明
        會務(wù)費 ¥3000

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        溫馨提示
        酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
        退款規(guī)則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

        會議支持:

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          具體折扣標準請參見plus會員頁面
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        • 會員積分抵現(xiàn)
          根據(jù)會員等級的不同,每抵用1元可使用的積分也不一樣,具體可參見PLUS會員頁面。 僅PC站支持。

        部分參會單位

        主辦方?jīng)]有公開參會單位

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